- Sekretariat Daerah
- a. Bagian Pemerintahan Umum dan Otonomi Daerah
- b. Bagian Kesejahteraan Rakyat
- c. Bagian Hukum
- d. Bagian Perekonomian
- e. Bagian Administrasi Pembangunan
- f. Bagian Pengadaan Barang / Jasa
- g. Bagian Organisasi
- h. Bagian Protokol dan Komunikasi Pimpinan
- i. Bagian Umum
- Sekretariat DPRD
- Inspektorat Daerah
- Dinas Pendidikan
- Dinas Kesehatan
- Dinas Perumahan Rakyat dan Kawasan Permukiman
- Satuan Polisi Pamong Praja
- Dinas Sosial
- Dinas Pemadam Kebakaran dan Penyelamatan
- Dinas Ketenagakerjaan
- Dinas Pemberdayaan Perempuan dan Perlindungan Anak
- Dinas Ketahanan Pangan
- Dinas Lingkungan Hidup
- Dinas Kependudukan dan Pencatatan Sipil
- Dinas Pemberdayaan Masyarakat dan Desa
- Dinas Pengendalian Penduduk dan Keluarga Berencana
- Dinas Perhubungan
- Dinas Komunikasi dan Informatika
- Dinas Penanaman Modal dan Pelayanan Terpadu Satu Pintu
- Dinas Perpustakaan
- Dinas Pertanian
- Dinas Pariwisata
- Dinas Perdagangan
- Badan Perencanaan, Penelitian dan Pengembangan Daerah
- Badan Keuangan Daerah
- Badan Kepegawaian dan Pengembangan Sumber Daya Manusia
- Kecamatan Padangsidimpuan Utara
- Kecamatan Padangsidimpuan Selatan
- Kecamatan Padangsidimpuan Batunadua
- Kecamatan Padangsidimpuan Hutaimbaru
- Kecamatan Padangsidimpuan Tenggara
- Kecamatan Padangsidimpuan Angkola Julu
- Kantor Kesatuan Bangsa Dan Politik
- Badan Penanggulangan Bencana Daerah
- Rumah Sakit Umum Daerah
- Dinas PUPR